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两栖动物比恒温动物进化更“慢”

2015-3-6 10:40

来源:人民网|1017人参与|0评论

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高山倭蛙基因组的破译,进一步确认了更多的人类、鸟类、甚至蛙类基因组中的染色体断裂和融合区域,同时也鉴定了两栖动物中高度保守的区域,为后续的两栖动物比较基因组学提供了良好的研究基础。

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记者从中国科学院了解到,中科院昆明动物研究所张亚平院士以及车静研究员课题组与华大基因国家基因库及德克萨斯大学奥斯汀分校等单位合作,成功破译了首个“现代蛙类”—高山倭蛙(Nanorana parkeri)的基因组。并且进一步证明两栖动物具有比恒温动物更低的进化速率。

据了解,两栖动物作为脊椎动物的一个重要分支,目前已知包括7000多个物种,代表着脊椎动物从水生到陆生这一伟大转变的过渡类群,在物种进化的研究中处于比较关键的位置。随着基因组测序、组装、及注释技术的不断发展和提高,通过破译物种的基因组信息,并通过一系列基因组的比较分析已经成为目前研究基因组的进化模式的较普遍的研究思路。然而对于两栖动物这一重要的生物类群,目前仅有热带爪蟾一个物种的基因组被测定,但热带爪蟾并不能充分地代表两栖动物。因此,测定“现代蛙类”基因组具有重要的意义。

高山倭蛙系青藏高原的土著物种,同时也是青藏高原上的绝对优势种,该基因组的破译同时也为研究两栖类物种的高原适应奠定了基础。昆明动物所的孙艳波博士与国家基因库的熊子军和向薛雁等研究人员共同合作完成高山倭蛙的样品收集、测序组装注释,以及后续的比较基因组学分析。通过比较高山倭蛙和热带爪蟾二者的基因组,他们发现前者拥有更大的基因组,且这种基因组大小上的差异主要归因于两者基因组中转座元件的含量不同。

研究人员还估算了高山倭蛙和热带爪蟾的分歧时间大概在2.66亿年前,比TimeTree项目中记录的时间早了4千万年。尽管两者分歧时间很久,但是两物种染色体间的重排特别少,说明蛙类基因组可能具有相对较慢的进化速率。这一猜想在染色体内部重排速率、基因区及全基因组的替换速率等多个层面都得到证实,即两栖动物,甚至整个冷血动物,具有比恒温动物更低的进化速率。

此外,高山倭蛙基因组的破译,进一步确认了更多的人类、鸟类、甚至蛙类基因组中的染色体断裂和融合区域,同时也鉴定了两栖动物中高度保守的区域,为后续的两栖动物比较基因组学提供了良好的研究基础。

该工作得到了中国科学院先导专项(B)、国家自然科学基金等的支持,研究结果近期已发表在著名刊物PNAS上。

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